Факультет прикладной математики существует в структуре Филиала с 2008 года. Факультет готовит бакалавров и магистров по направлению "Математика и компьютерные науки".

В последние десятилетия значение математики в общей системе человеческих знаний сильно возросло. С помощью математических методов изучается строение кристаллов и молекул химических веществ, предсказываются место и глубина залегания полезных ископаемых, прогнозируется погода, анализируются экономические процессы и оптимизируется управление экономическими системами, ставятся диагнозы болезней, обосновываются выводы социологических исследований. Математика является основой и для современных информационных технологий, математические методы используются для защиты информации.

Учебные планы факультета прикладной математики охватывают все современные направления математики. Изучаются такие фундаментальные дисциплины, как математический анализ, высшая алгебра, аналитическая геометрия, линейная алгебра и геометрия, дифференциальные уравнения, комплексный анализ, дифференциальная геометрия и топология, уравнения математической физики, теория функций и функциональный анализ, теория вероятностей, математическая статистика и другие курсы. Разумеется, читаются курсы прикладной направленности: численные методы и системное программирование, экономическая теория, актуарная и финансовая математика, алгоритмические языки, базы данных, операционные системы, прикладное программное обеспечение и др.  Обучение по программе этих курсов предполагает подготовку IT-профессионалов для видов деятельности, включающих создание и использование новых  информационных технологий, разработку и применение математических моделей процессов, использование современных математических методов для решения разных прикладных задач. Студенты факультета также  изучают историю и методологию математики, цикл гуманитарных дисциплин и английский язык. 

Начиная с третьего курса студенты  специализируются в различных областях чистой и прикладной математики под руководством выбранных ими научных руководителей. Лучшие из курсовых и дипломных работ представляются для участия в ежегодной Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых «Ломоносов». Жюри регионального этапа  конференции под председательством выдающегося математика профессора МГУ Сабира Меджидовича Гусейн-Заде определяет тех, кто будет выступать  в Москве. И каждый год наши лучшие студенты получают в МГУ премии и грамоты за свои научные доклады.  Отметим успехи наших студентов и в таких областях,  как математическое и программное обеспечение, защита информации, программирование.  Некоторые из студентов факультета  еще в годы обучения  удостаиваются  престижных сертификатов таких ИТ-компаний, как CISCO, Oracle. Такие сертификаты  открывают этим студентам дорогу для трудоустройства в крупных международных компаниях.

Команды факультета прикладной математики (тренер – доц. Григорьев Илья Сергеевич) регулярно выходят в полуфинал чемпионата мира по программированию среди вузов по версии ACM ICPC для команд Южно-Кавказского региона. Из последних достижений отметим, что на международных олимпиадах в сфере информационных технологий «IT-Планета 2013/14» и «IT-Планета 2014/15» магистрант Проскуряков Александр Игоревич занял первое место по республике Азербайджан в конкурсе компании Oracle по программированию SQL и магистрант Велиев Али Салман оглу — на международной олимпиаде «IT-Планета 2014/15» первое место по республике Азербайджан в конкурсе компании Oracle по программированию Java.