Филологический факультет Бакинского Государственного Университета был создан в 1919 году при учреждении университета в виде отделения языка-литературы и восточного отделения при историко-филологическом факультете. В первые годы деятельности университета на отделении язык-литература преподавалась специальность русский язык и литература, а на восточном отделении – нынешняя специальность азербайджанский язык и литература. Овладевавшие специальностью азербайджанский язык и литература студенты изучали также и арабский, персидский и турецкий языки, а также литературу и историю говоривших на этих языках народов. С 1922/23 учебного года восточное отделение стало самостоятельным факультетом и таким образом, с 30 марта 1922 года специальность русский язык и литература превратилась в самостоятельное отделение историко-филологического факультета, а специальность азербайджанский язык и литература стала самостоятельным сектором в составе отделения языкознания восточного факультета.
С 1923/24 учебного года историко-филологический факультет был преобразован в факультет общественных наук, а специальность русский язык и литература стала одним из трех отделений этого факультета. В 1924/25 учебном году факультет общественных наук был заменен педагогическим факультетом и в начале 1925/26 учебного года на этом факультете была прекращена деятельность отделения языка и литературы. А сектор азербайджанского языка и литературы продолжил свою деятельность в качестве самостоятельного отделения вплоть до решения СНК Азербайджанской ССР от 19 июня 1930 года о преобразовании Азербайджанского Государственного Университета в различные институты.
При учреждении Бакинского Государственного Университета первым деканом историко-филологического факультета стал профессор кафедры истории Николай Александрович Дубровский. Он проработал на этой должности 10 лет, а потом ее занял Леонид Александрович Ишков.
В начале 1920-х годов преподаванием филологии занимались непосредственно 10 кафедр: общего (сравнительного) языкознания, русской литературы, русского языка, истории западноевропейской литературы, классической филологии, славянской филологии, грузинской филологии, тюркологии, истории тюркской литературы, истории искусства. Позднее некоторые из них были ликвидированы – кафедра грузинской филологии была закрыта в 1922, а славянской филологии в 1924 году.
В 1920-х годах лекции по языку и литературе читали такие ученые, как В.В.Сиповский, В.И.Иванов, А.В.Багри, В.Б.Томашевский, Н.И.Ашмарин, Б.Чобанзаде, Р.И.Шор и др. С октября 1921 года дисциплину история азербайджанской литературы преподавал видный азербайджанский писатель и драматург А.Ахвердиев. С октября 1923 года заведующим кафедрой тюркологии был видный тюрколог Н.И.Ашмарин, а с марта 1925 года – другой видающийся тюрколог Б.Чобанзаде. На этой кафедре читал лекции знаменитый тюрколог академик А.И.Самойлович.
Хотя Азербайджанский Государственный Университет и восстановил свою деятельность в 1934/35 учебном году, филологический факультет был открыт лишь в августе 1939 года. На факультете готовили специалистов по двум специальностям – азербайджанский язык и литература, русский язык и литература. Первым деканом уже отдельного филологического факультета стал профессор кафедры русской литературы Александр Васильевич Багри.
В 1939/40 учебном году при факультете было создано 7 кафедр - азербайджанского языкознания, общего языкознания, азербайджанской литературы, практического курса азербайджанского языка, русского языкознания, практического курса русского языка, классической филологии.
В октябре 1943 года на филологическом факультете было создано восточное отделение, которое, однако, недолго оставалось в составе этого факультета, и уже в следующем учебном году было преобразовано в самостоятельный факультет.
В 1942-44 г.г. деканом филологического факультета был знаменитый ученый-языковед Мамедага Ширали оглы Ширалиев.
В 1945/46 учебном году на филологическом факультете было открыто отделение журналистики, в 1946/47 учебном году – отделения библиотечное дело, логика, психология и азербайджанский язык, значительно увеличилось количество кафедр. Появились кафедры русской литературы, западноевропейской литературы, истории и теории искусства, логики и психологии, библиотечного дела, теории и практики советской прессы.
Позднее отделились и стали самостоятельными факультетами отделения журналистики и библиотечного дела, а в 1951/52 учебном году была ликвидирована кафедра искусства. Кафедра логики и психологии действовала при факультете с 1947 по 1956 год.
С 1945 года факультет возглавляли видные ученые доц. Габибуллах Самедзаде (1945-1947), доц. Джафар Хандан Гаджиев (1947-1949), доц. Мамед Джафар Джафаров (1949-1951), проф. Али Султанлы (1951-1953), доц. Мухтар Гусейнзаде (1953-1957), проф. Али Султанлы (1957-1959), доц. Сейфулла Алиев (1959-1962), проф. Аловсат Абдуллаев (1962-1967), проф. Агамуса Ахундов (1967-1974), проф. Акбер Агаев (1974-1976), проф. Фирудин Гусейнов (1976-1980), проф. Агамуса Ахундов (1980-1990), проф. Агил Гаджиев (1991-1992), проф. Низами Джафаров (1994-2001), проф. Гара Намазов (2002-2006), проф. Эльбрус Азизов (2006-2011).
27 мая 2011 года деканом факультета избран доцент кафедры классической азербайджанской литературы Велиев Магеррам Тахир оглы.
В настоящее время на филологическом факультете действуют ступени бакалавриат и магистратура. На ступени бакалавриата готовятся специалисты по восьми специальностям:

Филолог (азербайджанский язык и литература)Филолог (русский язык и литература)Немецкий язык и литератураФранцузский язык и литератураУчитель азербайджанского языка и литературыУчитель иностранного языка и литературы (русский язык и литература)Учитель немецкого языкаУчитель французского языка